Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ophn1Q99J31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ophn1Q99J31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms