Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc50Q810U5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc50Q810U5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms