Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4Q17RY0 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 57.83□□□□□ -1.167e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 56.87□□□□□ -1.317e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-209ENST00000480464 790 ntTSL 25.89□□□□□ -1.477e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-214ENST00000613177 379 ntTSL 35.42□□□□□ -1.547e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-212ENST00000611008 929 ntTSL 54.68□□□□□ -1.667e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 54.53□□□□□ -1.687e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 54.53□□□□□ -1.687e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 53.98□□□□□ -1.777e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-204ENST00000622108 645 ntTSL 53.86□□□□□ -1.797e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-202ENST00000475819 885 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-13■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-13■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 215.33■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 514.03□□□□□ -0.165e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 313.64□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 513.47□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.315e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.895e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.085e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 58.01□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 27.15□□□□□ -1.265e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 56.94□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.29□□□□□ -1.45e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 56.13□□□□□ -1.437e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 35.1□□□□□ -1.597e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 34.71□□□□□ -1.667e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 32.47□□□□□ -2.017e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 411.23□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 29.36□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 57.52□□□□□ -1.212e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 25.59□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 51 of 1,751 protein–RNA pairs in 21.2 ms