Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp4r2Q0VGB7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp4r2Q0VGB7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp4r2Q0VGB7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms