Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx2Q00262 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms