Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shox2P70390 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shox2P70390 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shox2P70390 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shox2P70390 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shox2P70390 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shox2P70390 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shox2P70390 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shox2P70390 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shox2P70390 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shox2P70390 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shox2P70390 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shox2P70390 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Shox2P70390 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Shox2P70390 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shox2P70390 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Shox2P70390 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shox2P70390 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shox2P70390 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms