Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac1O09106 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac1O09106 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms