Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1aQ9JLR9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms