Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem239Q9DA47 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms