Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChtopQ9CY57 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms