Protein–RNA interactions for Protein: Q06683

IRC3, Putative ATP-dependent helicase IRC3, yeastyeast

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IRC3Q06683 TEA1YOR337W 2280 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 PDR18YNR070W 4002 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 NTG1YAL015C 1200 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YKL031WYKL031W 414 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 RMA1YKL132C 1293 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 MRPL36YBR122C 534 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YBR144CYBR144C 315 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 EMW1YNL313C 2715 nt7.07□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 ERG3YLR056W 1098 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YLR122CYLR122C 378 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 LST8YNL006W 912 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 KNS1YLL019C 2214 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 NMT1YLR195C 1368 nt7.06□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 HRQ1YDR291W 3234 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 KNH1YDL049C 807 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 SFC1YJR095W 969 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YHM2YMR241W 945 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 ATO2YNR002C 849 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 ARR3YPR201W 1215 nt7.05□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 BCY1YIL033C 1251 nt7.04□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 SSO1YPL232W 873 nt7.04□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 UTR2YEL040W 1404 nt7.03□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 YTP1YNL237W 1380 nt7.03□□□□□ -1.28
IRC3Q06683 GPB2YAL056W 2643 nt7.02□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 LCP5YER127W 1074 nt7.02□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 FAF1YIL019W 1041 nt7.02□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YCL041CYCL041C 495 nt7.02□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 MSN2YMR037C 2115 nt7.01□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 ATG4YNL223W 1485 nt7.01□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 GIR2YDR152W 798 nt7.01□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 IRS4YKR019C 1848 nt7.01□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 MSS1YMR023C 1581 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 PRM10YJL108C 1152 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YLR194CYLR194C 765 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 RPS9AYPL081W 594 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 RPL21AYBR191W 483 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 ELP3YPL086C 1674 nt7□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YCL065WYCL065W 369 nt6.99□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 PHB1YGR132C 864 nt6.99□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 SRF1YDL133W 1314 nt6.99□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YDR154CYDR154C 351 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 RRP45YDR280W 918 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 RRP4YHR069C 1080 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 ERP2YAL007C 648 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 PGU1YJR153W 1086 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 MRPL13YKR006C 795 nt6.98□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.97□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 GUD1YDL238C 1470 nt6.97□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 VTS1YOR359W 1572 nt6.96□□□□□ -1.29
IRC3Q06683 YRA1YDR381W 681 nt6.96□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YNR042WYNR042W 429 nt6.96□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 HXT17YNR072W 1695 nt6.96□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YGL235WYGL235W 537 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 OPI8YKR035C 642 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 HST2YPL015C 1074 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YTH1YPR107C 627 nt6.95□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 EDC3YEL015W 1656 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YDL114WYDL114W 927 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YGR182CYGR182C 354 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 DMA1YHR115C 1251 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YLR118CYLR118C 684 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 DAL82YNL314W 768 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 TFB4YPR056W 1017 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SLX5YDL013W 1860 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 KIN1YDR122W 3195 nt6.94□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YGL036WYGL036W 2730 nt6.93□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 QNS1YHR074W 2145 nt6.93□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YMR010WYMR010W 1218 nt6.93□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 COX5AYNL052W 462 nt6.93□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SHM1YBR263W 1473 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 BDF2YDL070W 1917 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 TRR1YDR353W 960 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 COG1YGL223C 1254 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YGR176WYGR176W 348 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YPL062WYPL062W 405 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 PGM1YKL127W 1713 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 KKQ8YKL168C 2175 nt6.92□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 GLE1YDL207W 1617 nt6.91□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YEA6YEL006W 1008 nt6.91□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SRP101YDR292C 1866 nt6.91□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 YJR015WYJR015W 1533 nt6.91□□□□□ -1.3
IRC3Q06683 SES1YDR023W 1389 nt6.9□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 TIM54YJL054W 1437 nt6.9□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 AMD1YML035C 2433 nt6.9□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 YAP1801YHR161C 1914 nt6.89□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.89□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.89□□□□□ -1.31
IRC3Q06683 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms