Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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