Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trabd2bB1ATG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms