Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcsQ9WU84 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CcsQ9WU84 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcsQ9WU84 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms