Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CcsQ9WU84 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CcsQ9WU84 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CcsQ9WU84 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CcsQ9WU84 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcsQ9WU84 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcsQ9WU84 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcsQ9WU84 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CcsQ9WU84 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcsQ9WU84 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CcsQ9WU84 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcsQ9WU84 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcsQ9WU84 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcsQ9WU84 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CcsQ9WU84 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcsQ9WU84 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcsQ9WU84 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CcsQ9WU84 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcsQ9WU84 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcsQ9WU84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsQ9WU84 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcsQ9WU84 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcsQ9WU84 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcsQ9WU84 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcsQ9WU84 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcsQ9WU84 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcsQ9WU84 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcsQ9WU84 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcsQ9WU84 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcsQ9WU84 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcsQ9WU84 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CcsQ9WU84 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CcsQ9WU84 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcsQ9WU84 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcsQ9WU84 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcsQ9WU84 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcsQ9WU84 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcsQ9WU84 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcsQ9WU84 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcsQ9WU84 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsQ9WU84 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsQ9WU84 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CcsQ9WU84 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcsQ9WU84 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcsQ9WU84 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcsQ9WU84 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcsQ9WU84 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcsQ9WU84 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcsQ9WU84 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcsQ9WU84 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcsQ9WU84 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcsQ9WU84 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcsQ9WU84 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CcsQ9WU84 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcsQ9WU84 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcsQ9WU84 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcsQ9WU84 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcsQ9WU84 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcsQ9WU84 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcsQ9WU84 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CcsQ9WU84 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CcsQ9WU84 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcsQ9WU84 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CcsQ9WU84 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsQ9WU84 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsQ9WU84 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsQ9WU84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsQ9WU84 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcsQ9WU84 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcsQ9WU84 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcsQ9WU84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CcsQ9WU84 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcsQ9WU84 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcsQ9WU84 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcsQ9WU84 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CcsQ9WU84 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CcsQ9WU84 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CcsQ9WU84 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CcsQ9WU84 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CcsQ9WU84 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CcsQ9WU84 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CcsQ9WU84 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CcsQ9WU84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CcsQ9WU84 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CcsQ9WU84 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CcsQ9WU84 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CcsQ9WU84 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms