Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SpastQ9QYY8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SpastQ9QYY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms