Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D9D9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9D9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9D9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9D9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9D9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9D9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9D9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9D9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9D9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9D9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms