Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Q9D9D9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Q9D9D9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Q9D9D9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Q9D9D9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Q9D9D9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Q9D9D9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Q9D9D9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Q9D9D9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Q9D9D9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Q9D9D9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Q9D9D9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Q9D9D9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Q9D9D9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Q9D9D9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Q9D9D9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Q9D9D9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Q9D9D9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Q9D9D9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Q9D9D9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Q9D9D9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Q9D9D9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Q9D9D9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Q9D9D9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Q9D9D9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Q9D9D9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Q9D9D9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Q9D9D9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Q9D9D9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Q9D9D9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Q9D9D9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Q9D9D9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Q9D9D9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Q9D9D9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Q9D9D9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Q9D9D9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Q9D9D9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Q9D9D9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Q9D9D9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Q9D9D9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Q9D9D9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Q9D9D9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Q9D9D9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Q9D9D9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Q9D9D9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Q9D9D9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Q9D9D9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Q9D9D9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Q9D9D9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Q9D9D9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Q9D9D9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Q9D9D9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Q9D9D9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Q9D9D9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Q9D9D9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Q9D9D9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Q9D9D9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Q9D9D9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Q9D9D9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Q9D9D9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Q9D9D9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q9D9D9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Q9D9D9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q9D9D9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Q9D9D9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Q9D9D9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9D9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9D9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9D9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q9D9D9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9D9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9D9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9D9D9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9D9D9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Q9D9D9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9D9D9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9D9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9D9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9D9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9D9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Q9D9D9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Q9D9D9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Q9D9D9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Q9D9D9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Q9D9D9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Q9D9D9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Q9D9D9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Q9D9D9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Q9D9D9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Q9D9D9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Q9D9D9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q9D9D9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9D9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q9D9D9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9D9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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