Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tspo2Q9CRZ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspo2Q9CRZ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms