Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna12Q80SS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms