Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtl5Q5DTT4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtl5Q5DTT4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 809.1 ms