Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnikP83510 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnikP83510 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TnikP83510 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnikP83510 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnikP83510 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnikP83510 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnikP83510 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnikP83510 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnikP83510 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnikP83510 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnikP83510 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnikP83510 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnikP83510 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnikP83510 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnikP83510 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnikP83510 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnikP83510 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnikP83510 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnikP83510 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TnikP83510 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TnikP83510 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnikP83510 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnikP83510 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnikP83510 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnikP83510 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnikP83510 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnikP83510 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnikP83510 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnikP83510 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnikP83510 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnikP83510 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnikP83510 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnikP83510 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnikP83510 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnikP83510 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnikP83510 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnikP83510 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnikP83510 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnikP83510 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnikP83510 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnikP83510 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnikP83510 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnikP83510 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnikP83510 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnikP83510 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnikP83510 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnikP83510 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnikP83510 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnikP83510 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnikP83510 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnikP83510 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnikP83510 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms