Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa11P50709 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa11P50709 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa11P50709 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa11P50709 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms