Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod1P49813 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms