Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klra1P20937 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klra1P20937 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klra1P20937 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klra1P20937 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klra1P20937 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klra1P20937 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klra1P20937 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klra1P20937 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klra1P20937 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1621.4 ms