Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp8O70404 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms