Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nedd9O35177 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd9O35177 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms