Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Nedd9O35177 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Nedd9O35177 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nedd9O35177 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Nedd9O35177 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Nedd9O35177 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Nedd9O35177 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nedd9O35177 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nedd9O35177 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nedd9O35177 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nedd9O35177 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Nedd9O35177 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nedd9O35177 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nedd9O35177 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nedd9O35177 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nedd9O35177 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Nedd9O35177 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nedd9O35177 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nedd9O35177 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nedd9O35177 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nedd9O35177 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nedd9O35177 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nedd9O35177 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Nedd9O35177 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nedd9O35177 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Nedd9O35177 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nedd9O35177 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nedd9O35177 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nedd9O35177 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nedd9O35177 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nedd9O35177 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nedd9O35177 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Nedd9O35177 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nedd9O35177 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nedd9O35177 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nedd9O35177 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Nedd9O35177 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nedd9O35177 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nedd9O35177 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nedd9O35177 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nedd9O35177 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nedd9O35177 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nedd9O35177 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nedd9O35177 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nedd9O35177 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nedd9O35177 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nedd9O35177 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Nedd9O35177 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nedd9O35177 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Nedd9O35177 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nedd9O35177 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nedd9O35177 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nedd9O35177 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nedd9O35177 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nedd9O35177 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nedd9O35177 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nedd9O35177 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nedd9O35177 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nedd9O35177 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nedd9O35177 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nedd9O35177 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nedd9O35177 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nedd9O35177 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nedd9O35177 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nedd9O35177 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nedd9O35177 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nedd9O35177 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nedd9O35177 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nedd9O35177 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nedd9O35177 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nedd9O35177 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nedd9O35177 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nedd9O35177 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nedd9O35177 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nedd9O35177 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nedd9O35177 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd9O35177 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nedd9O35177 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nedd9O35177 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nedd9O35177 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nedd9O35177 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nedd9O35177 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nedd9O35177 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nedd9O35177 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nedd9O35177 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nedd9O35177 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nedd9O35177 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nedd9O35177 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nedd9O35177 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nedd9O35177 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nedd9O35177 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nedd9O35177 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nedd9O35177 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nedd9O35177 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nedd9O35177 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nedd9O35177 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nedd9O35177 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nedd9O35177 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nedd9O35177 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nedd9O35177 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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