Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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