Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trabd2bB1ATG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trabd2bB1ATG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trabd2bB1ATG9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms