Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apobec2Q9WV35 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec2Q9WV35 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms