Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx21Q9JIK5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx21Q9JIK5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms