Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12aQ99PQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim12aQ99PQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
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