Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp1Q6A037 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp1Q6A037 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms