Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a2Q07643 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a2Q07643 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms