Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2fP61219 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2fP61219 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2fP61219 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms