Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnc1O35914 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnc1O35914 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bnc1O35914 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms