Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC12

Cdan1, Codanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdan1Q8CC12 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdan1Q8CC12 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdan1Q8CC12 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdan1Q8CC12 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms