Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr2Q62371 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddr2Q62371 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddr2Q62371 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms