Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q504N7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q504N7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q504N7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q504N7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q504N7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q504N7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q504N7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q504N7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q504N7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q504N7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q504N7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q504N7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q504N7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q504N7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q504N7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q504N7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q504N7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q504N7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q504N7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q504N7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q504N7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q504N7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q504N7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q504N7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q504N7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q504N7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q504N7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q504N7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q504N7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q504N7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q504N7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q504N7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q504N7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q504N7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q504N7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms