Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc110Q3V125 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc110Q3V125 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms