Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srebf2Q3U1N2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srebf2Q3U1N2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srebf2Q3U1N2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms