Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Teddm2Q208S0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Teddm2Q208S0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Teddm2Q208S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms