Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 MSO1YNR049C 633 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 YFL052WYFL052W 1398 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 SGE1YPR198W 1632 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 GPH1YPR160W 2709 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 YOR389WYOR389W 1875 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 ERS1YCR075C 783 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 YML018CYML018C 1182 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 ARC35YNR035C 1029 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 RFC4YOL094C 972 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 YPL257WYPL257W 582 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 UIP5YKR044W 1332 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 CMR1YDL156W 1569 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 RRP9YPR137W 1722 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 VMA3YEL027W 483 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 MSP1YGR028W 1089 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 TDH2YJR009C 999 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 HMS2YJR147W 1077 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 RMA1YKL132C 1293 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 MIA40YKL195W 1212 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP46Q12417 ZWF1YNL241C 1518 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 HHY1YEL059W 309 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 LYS1YIR034C 1122 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YNR014WYNR014W 639 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 ARE2YNR019W 1929 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 PPH22YDL188C 1134 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 SRL2YLR082C 1179 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 SRF1YDL133W 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 GSH1YJL101C 2037 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 ATG36YJL185C 882 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YJR146WYJR146W 354 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 SCS7YMR272C 1155 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 OPI11YPR044C 354 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 CYB2YML054C 1776 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 TFC6YDR362C 2019 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 CDC11YJR076C 1248 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YGR054WYGR054W 1929 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YDR387CYDR387C 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YMR279CYMR279C 1623 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YBR241CYBR241C 1467 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 NTG1YAL015C 1200 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 GCN3YKR026C 918 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 RUF23RUF23 254 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 EDE1YBL047C 4146 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 GUF1YLR289W 1938 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 MDE1YJR024C 735 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 MEU1YLR017W 1014 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 MRPL10YNL284C 969 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 PTC4YBR125C 1182 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 ELP3YPL086C 1674 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 HEM1YDR232W 1647 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP46Q12417 VTS1YOR359W 1572 nt5.84□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 PTC3YBL056W 1407 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 MPC2YHR162W 390 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 GTO3YMR251W 1101 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YMR295CYMR295C 594 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 OPT1YJL212C 2400 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 PAP2YOL115W 1755 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YPR196WYPR196W 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YLL066CYLL066C 3618 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YLL067CYLL067C 3618 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 PEX31YGR004W 1389 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 QCR6YFR033C 444 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 VPS24YKL041W 675 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 FSF1YOR271C 984 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 ACO1YLR304C 2337 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 EFM1YHL039W 1758 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 HEM2YGL040C 1029 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 COG1YGL223C 1254 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 COX16YJL003W 357 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 FPR3YML074C 1236 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YNL120CYNL120C 486 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 ECM31YBR176W 939 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 LDB16YCL005W 771 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 RSC2YLR357W 2670 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 HXT15YDL245C 1704 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 HXT16YJR158W 1704 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 MSN2YMR037C 2115 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 SEC23YPR181C 2307 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 YKR032WYKR032W 315 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 OGG1YML060W 1131 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 KSH1YNL024C-A 219 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP46Q12417 RNH201YNL072W 924 nt5.8□□□□□ -1.48
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