Protein–RNA interactions for Protein: Q12348

RRI2, COP9 signalosome complex subunit 10, yeastyeast

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI2Q12348 MIA40YKL195W 1212 nt7.62□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.62□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.62□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 ARC35YNR035C 1029 nt7.62□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 YOS9YDR057W 1629 nt7.62□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 VPS24YKL041W 675 nt7.61□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 OPI11YPR044C 354 nt7.61□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 RGT2YDL138W 2292 nt7.61□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 YGR054WYGR054W 1929 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 BNA3YJL060W 1335 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 HGH1YGR187C 1185 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 PUS5YLR165C 765 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 RFS1YBR052C 633 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 PTC4YBR125C 1182 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 ASN2YGR124W 1719 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 BUD9YGR041W 1644 nt7.6□□□□□ -1.19
RRI2Q12348 DSF1YEL070W 1509 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YNR073CYNR073C 1509 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GGC1YDL198C 903 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 FHN1YGR131W 525 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YHL018WYHL018W 363 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GTO3YMR251W 1101 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 ATP4YPL078C 735 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 EDE1YBL047C 4146 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GDA1YEL042W 1557 nt7.58□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YBR241CYBR241C 1467 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 HVG1YER039C 750 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 MED6YHR058C 888 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 MDE1YJR024C 735 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 FPR3YML074C 1236 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 CCR4YAL021C 2514 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GPH1YPR160W 2709 nt7.57□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 AQR1YNL065W 1761 nt7.56□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 OGG1YML060W 1131 nt7.56□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 KSH1YNL024C-A 219 nt7.56□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YNR014WYNR014W 639 nt7.56□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GPA1YHR005C 1419 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YLL066CYLL066C 3618 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YLL067CYLL067C 3618 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 PRE3YJL001W 648 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GCN3YKR026C 918 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 COQ3YOL096C 939 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 HEM1YDR232W 1647 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 ERG1YGR175C 1491 nt7.55□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.54□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 HHY1YEL059W 309 nt7.54□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 ZRT2YLR130C 1269 nt7.54□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 ECM31YBR176W 939 nt7.54□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 CYB2YML054C 1776 nt7.54□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 RVB2YPL235W 1416 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YNL120CYNL120C 486 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 ADH5YBR145W 1056 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 LDB16YCL005W 771 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 GSH1YJL101C 2037 nt7.52□□□□□ -1.2
RRI2Q12348 YJR084WYJR084W 1272 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 GLC8YMR311C 690 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 TSR3YOR006C 942 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 RPS28AYOR167C 204 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 ELP3YPL086C 1674 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 FRT1YOR324C 1809 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 SDH4YDR178W 546 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 RAD59YDL059C 717 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 HEM2YGL040C 1029 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 COX16YJL003W 357 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 NTG1YAL015C 1200 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 PSR2YLR019W 1194 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 AAT2YLR027C 1257 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 NSE5YML023C 1671 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 CHS5YLR330W 2016 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 PEX31YGR004W 1389 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 YDR415CYDR415C 1125 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 TOS6YNL300W 309 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 LYS21YDL131W 1323 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 PPT1YGR123C 1542 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 TIM22YDL217C 624 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 YPT1YFL038C 621 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 MOG1YJR074W 657 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 MEH1YKR007W 555 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 CTF3YLR381W 2202 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 NDE1YMR145C 1683 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 NMD5YJR132W 3147 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 CRF1YDR223W 1404 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 YKR032WYKR032W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 YNL165WYNL165W 1221 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI2Q12348 SPS22YCL048W 1392 nt7.46□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 MSY1YPL097W 1479 nt7.45□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 JIP4YDR475C 2631 nt7.45□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 ATF1YOR377W 1578 nt7.44□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 IVY1YDR229W 1362 nt7.44□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 SQT1YIR012W 1296 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 FBA1YKL060C 1080 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 YJR107WYJR107W 987 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 RPL5YPL131W 894 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 PEX3YDR329C 1326 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 THI2YBR240C 1353 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 EMP65YER140W 1671 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 EFM1YHL039W 1758 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI2Q12348 PRY3YJL078C 2646 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.2 ms