Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 NUP49YGL172W 1419 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 SKN1YGR143W 2316 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 HED1YDR014W-A 489 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 AGX1YFL030W 1158 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 DYS1YHR068W 1164 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 IRC11YOR013W 471 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 LGE1YPL055C 999 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR111CQ04461 YMR034CYMR034C 1305 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PPH22YDL188C 1134 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YSC83YHR017W 1158 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 RPL5YPL131W 894 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YPR076WYPR076W 375 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PEX31YGR004W 1389 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PAT1YCR077C 2391 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 QNS1YHR074W 2145 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 RIX7YLL034C 2514 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 RMD9YGL107C 1941 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 MRPL19YNL185C 477 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 COS10YNR075W 1125 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 DFR1YOR236W 636 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 HST2YPL015C 1074 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 SPE3YPR069C 882 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 DOT1YDR440W 1749 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YHR020WYHR020W 2067 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 MIP1YOR330C 3765 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YPR204WYPR204W 3099 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PCS60YBR222C 1632 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 RPO26YPR187W 468 nt6.49□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 MED6YHR058C 888 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 LDB7YBL006C 543 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YNL092WYNL092W 1203 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 TOS6YNL300W 309 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 BIO3YNR058W 1443 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 STT3YGL022W 2157 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PPM2YOL141W 2088 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 LSG1YGL099W 1923 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 BZZ1YHR114W 1902 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 ELP3YPL086C 1674 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 PPH21YDL134C 1110 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 YJR107WYJR107W 987 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 TMA46YOR091W 1038 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 JIP4YDR475C 2631 nt6.46□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 MPH3YJR160C 1809 nt6.46□□□□□ -1.37
YMR111CQ04461 NCS6YGL211W 1080 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 URA1YKL216W 945 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 GCN3YKR026C 918 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 ASN1YPR145W 1719 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 OPT1YJL212C 2400 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 COQ1YBR003W 1422 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 ADH5YBR145W 1056 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 SUB2YDL084W 1341 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YMR027WYMR027W 1413 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 HEM1YDR232W 1647 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YDR415CYDR415C 1125 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 HEM2YGL040C 1029 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YGL072CYGL072C 360 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 ATG36YJL185C 882 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 OPI8YKR035C 642 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 SWD1YAR003W 1281 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 ASR1YPR093C 867 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YDR387CYDR387C 1668 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 STE13YOR219C 2796 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YKL077WYKL077W 1179 nt6.43□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 FMP40YPL222W 2067 nt6.42□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YPT1YFL038C 621 nt6.42□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YKL102CYKL102C 306 nt6.42□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 CWC27YPL064C 906 nt6.42□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 SRP101YDR292C 1866 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 EDE1YBL047C 4146 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 HIS1YER055C 894 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 ESC8YOL017W 2145 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 COX15YER141W 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 CRH1YGR189C 1524 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 PLB3YOL011W 2061 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 HSP150YJL159W 1242 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 HOC1YJR075W 1191 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 CUE4YML101C 354 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 PUS4YNL292W 1212 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 AAD14YNL331C 1131 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 MRPL23YOR150W 492 nt6.4□□□□□ -1.38
YMR111CQ04461 YJL144WYJL144W 315 nt6.39□□□□□ -1.39
YMR111CQ04461 DID2YKR035W-A 615 nt6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms