Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp4cP97470 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4cP97470 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4cP97470 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4cP97470 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4cP97470 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms