Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 SNF4YGL115W 969 nt7.26□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 MIA40YKL195W 1212 nt7.26□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 OGG1YML060W 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RGT2YDL138W 2292 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YDL218WYDL218W 954 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 BUD32YGR262C 786 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 MDE1YJR024C 735 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YNL285WYNL285W 372 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 ENV7YPL236C 1095 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RGD2YFL047W 2145 nt7.25□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 EGD2YHR193C 525 nt7.24□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SPE4YLR146C 903 nt7.24□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YPL102CYPL102C 303 nt7.24□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 ECM31YBR176W 939 nt7.24□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 TOD6YBL054W 1578 nt7.24□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YDL172CYDL172C 480 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SYF2YGR129W 648 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 MTR3YGR158C 753 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 ECM19YLR390W 339 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 MIP1YOR330C 3765 nt7.23□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 PPT1YGR123C 1542 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 KSH1YNL024C-A 219 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 LDB16YCL005W 771 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 EDE1YBL047C 4146 nt7.22□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 SLA2YNL243W 2907 nt7.21□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 GPA1YHR005C 1419 nt7.21□□□□□ -1.25
YBL028CP38202 YDR015CYDR015C 240 nt7.21□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 NTE1YML059C 5040 nt7.21□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 HEM1YDR232W 1647 nt7.2□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 MAK31YCR020C-A 267 nt7.2□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 ERP5YHR110W 639 nt7.2□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 SUR7YML052W 909 nt7.2□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 CSL4YNL232W 879 nt7.2□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YBR241CYBR241C 1467 nt7.19□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 MEH1YKR007W 555 nt7.19□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 AIM34YMR003W 597 nt7.19□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YNL120CYNL120C 486 nt7.19□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 HBN1YCL026C-B 582 nt7.19□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 SKS1YPL026C 1509 nt7.18□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 DAL4YIR028W 1908 nt7.18□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 ITR1YDR497C 1755 nt7.18□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 MCH2YKL221W 1422 nt7.18□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 POX1YGL205W 2247 nt7.17□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 SGE1YPR198W 1632 nt7.17□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 ERS1YCR075C 783 nt7.17□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YNL017CYNL017C 339 nt7.17□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YOR012WYOR012W 414 nt7.17□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 BUG1YDL099W 1026 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 HEM2YGL040C 1029 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 HGH1YGR187C 1185 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 GCV3YAL044C 513 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 AIM2YAL049C 741 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 SHP1YBL058W 1272 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.16□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 RPS5YJR123W 678 nt7.15□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 RPS3YNL178W 723 nt7.15□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YNL200CYNL200C 741 nt7.15□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 ATO2YNR002C 849 nt7.15□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.15□□□□□ -1.26
YBL028CP38202 MTF2YDL044C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 CCT3YJL014W 1605 nt7.14□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 PRY3YJL078C 2646 nt7.14□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 JNM1YMR294W 1122 nt7.14□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 ICL1YER065C 1674 nt7.13□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 YET3YDL072C 612 nt7.13□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 DON1YDR273W 1098 nt7.13□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 YLR126CYLR126C 756 nt7.13□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 ARC35YNR035C 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 AMD2YDR242W 1650 nt7.12□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 ECM14YHR132C 1293 nt7.12□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 CAF40YNL288W 1122 nt7.12□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 TAH11YJR046W 1815 nt7.11□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 YER137CYER137C 447 nt7.11□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 RPP1YHR062C 882 nt7.11□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 ACO1YLR304C 2337 nt7.11□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 MNS1YJR131W 1650 nt7.1□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 PRS2YER099C 957 nt7.1□□□□□ -1.27
YBL028CP38202 YPT1YFL038C 621 nt7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms