Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dll3O88516 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms