Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrna9G3X8Z7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chrna9G3X8Z7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna9G3X8Z7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms