Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l1A2A259 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms