Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc6Q9R1S7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Abcc6Q9R1S7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc6Q9R1S7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc6Q9R1S7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms